Abbiamo solo tre regole. La prima: fai la tua parte. Non c'è spazio per i fannulloni. La seconda: non fare del male agli altri. Per andare avanti deve esserci fiducia tra noi. La terza e più importante: non provare a superare quei muri. Hai capito bene che ho detto?
Thomas si sveglia improvvisamente in un ascensore sotterraneo che lo sta portando alla Radura, una vasta zona erbosa circondata da un gigantesco Labirinto, e viene accolto da un gruppo di ragazzi che si fanno chiamare Radunai. Newt, uno di questi, gli spiega che è finito in una sorta di carcere e che l’unica via di fuga è attraversare il Labirinto. Ogni giorno, all’alba, i Velocisti, ovvero i più veloci e i più abili tra i Radunai, entrano nel Labirinto cercando un’uscita, e, nel caso l’uscita non venga trovata, sono costretti a ritornare prima di sera, perché l’ingresso del Labirinto si chiude al tramonto, e all’interno ci sono i Dolenti, creature che è meglio non incontrare.
In seguito alle difficoltà di alcuni amici, che restano intrappolati di notte nel labirinto, Thomas decide di andarli a cercare, sfidando i pericoli che la notte porta con sé.